上海石油化工研究院高性能計算項目-寶德計算

材料模擬（分子動力學方法）計算材料學的內涵可以概括為：根據材料科學和相關科學基本原理，通過模型化與計算實現對材料制備、加工、結構、性能和使役行為等參量或過程的定量描述，理解材料結構與性能、功能之間的關系，引導材料發現和發明，縮短材料研制周期，降低材料過程成本。

計算材料學主要包括兩個方面的內容：一方面是計算模擬，即從實驗數據出發，通過建立數學模型及數值計算，模擬實際過程；另一方面是材料的計算機設計，即直接通過理論模型和計算，預測或設計材料結構與性能。材料計算與模擬在材料性能設計、節約材料與節能、加快產業化進程中發揮著重要的作用。

分子動力學方法是一種計算機模擬實驗方法，是研究凝聚態系統的有力工具。該技術不僅可以得到原子的運動軌跡，還可以觀察到原子運動過程中各種微觀細節。它是對理論計算和實驗的有力補充。廣泛應用于材料科學、生物物理和藥物設計等。

本方案在寶德對 HPC 深刻理解的基礎上結合對用戶應用場景的深入分析而設計，可謂特色鮮明：

序號	對象	寶德方案特點
1	計算系統	計算系統由 10 臺寶德高密服務器（四子星）與 4 臺寶德自研四路胖節點組成，系統整體理論峰值性能達到 30.45TFlops，實測性能 25.36TFlops，效率超過了 80％。
2	網絡系統	采用業界最先進的 Infiniband 網絡技術，滿足應用對網絡的高帶寬和低延時的需求。
3	存儲系統	通過寶德 Pstor2000 分布式存儲系統，提高 IO 并發訪問性能

及單一存儲容量，實現多通道、多分區的并發讀寫和多分區的一

致印象和統一管理；高性能、高可擴展、高性價比。

集群管理

使用 WEB 界面管理方式，可提供所有組件的最新狀態及圖形標示的詳細信息；實時狀態監控、故障預警，動態優化調整資源配給和工作策略；保存并統計分析關鍵歷史數據；直觀顯現重要信息的變化趨勢；多種錯誤故障報警方式，日志、審計和報表可供查詢；允許加密的遠程控制，可從任何位置控制操作及監控整

體運行狀況。

安全系統

方案的設計充分考慮科研對于安全性的需求，從計算、存儲、網

絡，到用戶的接入訪問、權限控制等，都提供了安全策略。

技術服務

提供至少三年硬件免費保修服務，五年免費人工現場技術服務